EvaGreen TM

qPCR 荧光染料的最佳选择

 

也许您一直在努力寻找另一种选择。

现在,毋须再四处寻觅。 EvaGreen TM 不是另一种 SYBRGreen 1 ,它是一种最好的用于实时定量 PCR 实验的绿色荧光 DNA 染料。

EvaGreen TM 与 SYBR Green I 、SYBR GreenER、Power SYBR的比较

 
图 1. 分别使用 EvaGreen TM (白色正方形) 和 SYBRGreen I (黑色三角形)与人类基因 DNA 进行定量分析的 PCR 动力曲线图。 DNA 扩增是在 SYBR Green I 的最优条件下进行。  

图 2. 分别使用 EvaGreen TM (红色)、 SYBR GreenER TM (绿色, Invitrogen )和 Power SYBR TM (黄色, ABI )扩增 Myc 基因片段( 75ng huDNA , ABI )。所有反应均以复管形式使用相同的循环条件( 95 ℃ 15 秒, 60 ℃ 60 秒)在 ABI 7900 上完成。

极高的灵敏度

在推荐浓度下使用时可以获得最强的 PCR 扩增信号。

PCR 抑制性极小

智能化的“按要求释放” DNA 结合技术使得 EvaGreen 对 PCR 的抑制远小于 SYBR TM Green I 。

和快速 PCR 兼容

对 PCR 干扰极小,从而极大的缩短了 PCR 延伸时间。

非常适合 HRM 分析

无“染料重分布”缺陷,兼容 PCR 后的高分辨率熔解曲线( HRM )分析。

兼容多重 PCR

在推荐浓度下使用时,无扩增子之间的染料迁移现象。

超强稳定性

在大部分生化条件下非常稳定,可在室温下储存并可反复冻融。

优越的兼容性

和 SYBR TM GREEN I 光谱相似,和各知名品牌的 qPCR 仪器兼容。 用 EvaGreen TM 替代 SYBR Green 1 ,毋须改变任何您目前使用的操作步骤和仪器设备。

 

 

EvaGreen TM 是一种用于实时定量 PCR ( qPCR )的 DNA 结合染料。该染料的诸多优点使它远胜于 SYBR Green I 。除了有相似的光谱特性, EvaGreen TM 有三个主要特点使它区别于 SYBR Green I 。

首先, EvaGreen TM 对 PCR 的抑制性远小于 SYBR Green I 。因此,使用 EvaGreen TM 进行的 qPCR 实验可以使用快速 PCR 步骤(图 3 )。同时, EvaGreen TM 在实验中可以使用较高的浓度,从而获得远强于 SYBR Green I 扩增信号(图 2 )。较高浓度的 EvaGreen TM 也消除了“染料重分布”的缺陷,使 EvaGreen TM 既可用于多重 PCR ,也可用于高分辨率(高清晰)熔解曲线分析( HRM )(图 4 )。该分析正被越来越多的用于 PCR 后的基因分型和异源双链分析 。由于 SYBR Green I 对 PCR 的抑制性,从而要求其使用浓度必须很低,因此 SYBR Green I 无法解决由低浓度造成的染料重分布问题,既不能用于多重 PCR 也不能用于 HRM 。同时,染料重分布问题也可能影响常规熔解曲线的可靠性,因为低熔点的 DNA 链可能由于这种原因而无法检测到 。

第二, EvaGreen TM 的稳定性极强。在正常的储存、操作和 PCR 过程中不会被破坏。在缓冲溶液中的染料可以安全的储存在室温或冰箱里,也可以反复冻融。与之相反, SYBR Green I 不稳定而且降解后对 PCR 抑制性更强 。

EvaGreen TM 降低了细胞膜透性,因而比 SYBR Green 1 更加安全(图 6 )。独立实验室的测试结果显示, EvaGreen TM 既没有诱变性也没有细胞毒性 5 。相反,虽然 SYBR Green I 本身诱变性很弱,但它在细胞中可能抑制了正常 DNA 的修复机制,使其有诱变增强作用 6 。考虑到 PCR 的广泛使用,其安全性应该足够重视。

BIOTIUM 公司现提供四种 EvaGreen TM 产品: EvaGreen TM 20 × (#31000) 可稀释 20 倍后用于 qPCR ; 25mM EvaGreen TM DMSO 溶液 (#31002) 作为高浓度储液,为熟悉染料的研究人员设计 qPCR 配方,开发新应用提供更大的灵活性; EvaGreen TM Msater Mix(#31003) 含有除引物以外所有扩增目的 DNA 所需成分; EvaGreen TM Basic Mix(#31001) 和 master mix 相似但不含聚合酶。

   

图 3. 比较 EvaGreen TM Master Mix 和 Power SYBR TM Master Mix ( ABI )在 GAPDH 扩增中的效果。使用两步法通用循环条件,即 95 ℃ 下 15 秒以及 60 ℃ 下不同的退火 / 延伸时间(分别为 60 、 40 、 20 和 10 秒)。每个水平条代表 8 次实验中 Ct 值分布。数据显示,当把退火 / 延伸时间从 60 秒减为 10 秒时, EvaGreen TM Master Mix 只造成了 Ct 值约一个周期的延后,而 Power SYBR TM Master Mix 则造成了多达 5-6 个周期的延后以及重复性降低的现象。

     
 

图 4 . 在 Rotor Gene 6000 上使用 EvaGreen 进行高分辨率熔解曲线( HRM )分析可以明显的区分三个不同的基因型:突变型(红色)、杂合型(紫色)和野生型(蓝色)。(数据由 Corbett Research 提供)

图 5 . EvaGreen 在 PBS 缓冲溶液中结合 dsDNA 后的激发和发射光谱。

 

 

图 6 . 在 37 ℃ 下分别用 SYBR Green I ( 1.2 μ M , 左图 )和 EvaGreen ( 1.2 μ M ,右图) 孵育 Hela 细胞并用荧光显微镜观察。 30min 内未观察到 EvaGreen 染色细胞。但 SYBR Green I 孵育 5min 后观察到明显的细胞染色(数据未提供)。 30min 后, SYBR Green I 组细胞核内观察到大量绿色荧光(左图)。 SYBR Green I 能快速进入细胞,加上它已知的诱变增强性( Ohta et al. Mutation Research 492 , 91(2001) ),使它在常规 PCR 操作中存在潜在毒性。相反, EvaGreen 似乎完全没有细胞膜透性,这至少部分解释了 艾姆斯氏测试中无诱变性无细胞毒性的结果。( EvaGreen 完整的安全性报告可以从 Biotium 网站上下载 )

编号
产品名
规格
单价(rmb)
产地
 
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OPE001 EvaGreen qPCR Master Mix 50 Reactions
1.25 mL
¥300
中国
 
OPE002 EvaGreen qPCR Master Mix 200 Reactions
4x1.25 mL
¥950
中国
 
31000-s EvaGreen,20x(比SYBR Green 1 效果更好的RT-PCR定量专用试剂,操作方法完全一样。)
5x0.5 mL
¥850
美国
31000

EvaGreen,20x(比SYBR Green 1 效果更好的RT-PCR定量专用试剂,操作方法完全一样。)

5x1 mL
¥1700
美国

 

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--College of Chemistry and Chemical Engineering, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, P.R. China Received: January 15, 2006; revised: February 28, 2006; accepted: March 2, 2006(上海交通大学)

Transgenic Mice Expressing Tamoxifen-Inducible Cre for Somatic Gene Modi?cation in Renal Epithelial Cells--Received 23 September 2005; Accepted 3 February 2006

 

 

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